چارت سازمانی شرکت مهندسی معدنی نی ریز پارت نشان‌دهنده ساختاری منظم و تخصصی است که تمامی بخش‌های کلیدی مرتبط با فعالیت‌های معدنی و فرآوری مواد را پوشش می‌دهد. در رأس این ساختار، مدیرعامل قرار دارد که هدایت و نظارت کلی بر فعالیت‌های شرکت را بر عهده دارد. زیرمجموعه مدیریتی شامل سه بخش اصلی است: زمین‌شناسی، معدن و آزمایشگاه سنگ و خاک. در بخش زمین‌شناسی، تیم زمین‌شناسی به مطالعه و ارزیابی ذخایر معدنی می‌پردازد. بخش معدن به سه شاخه تخصصی اکتشاف، استخراج و فرآوری تقسیم می‌شود که توسط مهندسین معدن و مهندسین فرآوری پشتیبانی می‌گردد و وظیفه آن‌ها اجرای دقیق پروژه‌ها در هر مرحله از چرخه معدنی است. همچنین آزمایشگاه سنگ و خاک با حضور دو تکنسین آزمایشگاه، پشتیبانی فنی و علمی را برای تحلیل نمونه‌ها و بهبود کیفیت عملیات فراهم می‌آورد. این ساختار سازمانی، هماهنگی بین عملیات میدانی، تخصص‌های مهندسی و پشتیبانی آزمایشگاهی را تضمین کرده و شرکت را قادر می‌سازد تا خدمات خود را به شکلی جامع و حرفه‌ای ارائه دهد.